病毒SARS冠狀病毒2(SARS-CoV-2)是2019年冠狀病毒疾病(COVID-19)的已知原因。 “刺突”或S蛋白促進病毒進入宿主細胞。
現在,來自韓國首爾國立大學,英國劍橋大學和美國利哈伊大學的一組研究人員共同合作,開發了首個全長S蛋白的開源全原子模型。研究人員說,這特別重要,因為S蛋白在病毒進入細胞中起著核心作用,使其成為疫苗和抗地下運彩ptt病毒藥物開發的主要靶標。
可以在網上發表的論文《在病毒膜中建立全長糖基化的全長SARS-CoV-2穗蛋白模型》中找到詳細信息。 物理化學學報.
該視頻演示說明瞭如何根據其SARS-CoV-2 S蛋白模型構建此膜系統。該模型構建程序是開放訪問的,可以在CHARMM-GUI的主頁上找到,方法是單擊COVID-19存檔鏈接,或者單擊標題中的存檔鏈接,然後單擊左側的COVID-19蛋白質鏈接側邊欄。
CHARMM-GUI(GUI =圖形用戶界面)由利哈伊大學生物科學與生物工程學系教授Wonpil Im開發,CHARMM-GUI(GUI =圖形用戶界面)是一種簡單地模擬複雜生物分子系統的程序,大老爺娛樂城靈巧而迅速。我將其描述為支持科學和技術的“計算顯微鏡”任你博娛樂城理解要理解的分子水平相互作用是任何其他方法都無法觀察到的。可以在此視頻中找到有關CHARMM-GUI的更多信息。
Im說:“我們的模型是首個完全糖基化的全長SARS-CoV-2穗狀(S)蛋白模型,可供其他科學家使用。” “我很幸運與韓國首爾國立大學的Chaok Seok博士和T博士合作。博弈娛樂城英國劍橋大學的ristan Croll。我們的團隊日夜不停地從已知的cryo-EM結構部分中精心構建了這些模型。建模非常具有挑戰性,因為在許多地區,簡單的建模無法提供高質量的模型。”
Im說,科學家可以使用這些模型進行創新和新穎的模擬研究,以預防和治療COVID-19。
用cryo-EM測定S蛋白結構,其中RBD升高(PDB ID:6VSB),而RBD降低(PDB ID:6VXX)。但是,此模型有許多遺留的殘基。因此,他們首先對缺失的氨基酸殘基進行建模,然後對其他缺失的域進行建模。此外,他們對附著於S蛋白的所有潛在聚醣(或碳水化合物)進行了建模。這些聚醣阻止六合彩金額算法抗體識別,這使得難以開發疫苗。他們還建立了S蛋白的病毒膜系統,用於分子動力學模擬。
本文基於尚待同行評審的研究發現。因此,結果被認為是初步的,應該這樣解釋。在此處了解同行評審過程在研究中的作用。有關更多信息,請聯繫引用的來源。
Woo等。 (2020)。病毒膜中完全糖基化的全長SARS-CoV-2穗蛋白的建模和仿真。 捕 魚 達人 機 台生物受體DOI:https://doi.org/10.1101/(2020)。.05.20.103325。
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