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基於功能的測序分析單個細菌細胞的發散網-娛樂城

一種新的基於功能的測序技術,利用光鑷並利用重力的特性,可以使研究人員逐一分析細菌細胞。由中國科學院青島生物能源與生物過程技術研究所(QIBEBT)的研究人員進行的這項研究於6月9日在Small上發表。

細菌淘金娛樂城ells很小,以至於很難一次金合發娛樂城只分析一種細菌細胞或細菌。結果,必須同時分析其中許多(有時一次是數百萬)。這向我們全面介紹了這一群體,但它阻止了研究人員研究單個細菌之間的聯繫。發發網m的基因型或完整的基因組,以及其表型,或因其基因與環境相互作用而產生的特徵集。  

考慮基因型和表型之間區別的一種簡單方法是注意,雖然單個玉米植物的基因型可能允許其長到三英尺高,但如果不施用太多肥料,那麼玉米植物的表型可能就是它只能長到高兩英尺。   

基因型與表型之間的聯繫分析iwin娛樂城對於這麼大的生物,ype很簡單,也非常有用。 

長期以來,人們一直在尋求有關單個細菌的基因型與表型關係的類似見解,尤其是在傳染病方面,但受到細菌大小的阻礙,細菌的大小通常只有幾分之幾米。  

QIBEBT單細胞中心的研究人員開發了一種細菌分佈技術94大發網-娛樂城推薦拉曼激活重力驅動的單細胞封裝和測序或RAGE測序。在這項技術中,單個細胞的表型被一個一個地分析,然後小心地包裝在一個“皮升微滴”(一萬億分之一升)中,該微滴被輸出並在每個試管中在一個細胞中索引,以備以後進行基因測序。上。 

該過程涉及將兩個石英層粘結在一起的RAGE“芯片”,這些石英層具有入口孔,油井和蝕刻到其中的微通道。 “光學鑷子”或產生吸引力或排斥力的高度聚焦的激光束在重力的輔助下通過通道操縱液體中的細菌。  

然後使用“拉曼光譜法”(Raman spectroscopy)通過檢測窗口研究細菌的形式,結構和代謝特徵-本質上是其表型-一種利用光與材料內化學鍵相互作用的分析技術。  

“最後細菌是恩卡娛樂城比較在微滴中濃縮,然後轉移到試管中進行基因測序或細胞培養,”該研究的通訊作者馬波教授說。 

研究團隊的研究生許騰說,微滴包裝非常重要,因為它可以使單個細菌細胞中非常少量的DNA以非常均勻的方式擴增,這是充分解碼其基因組的關鍵挑戰。開發了該方法。   

“我們玩運彩能夠直接從尿液樣本中同時從一個細胞同時獲得抗生素抗性特徵和基本完整的基因組序列。這為細菌診斷和藥物治療提供了最大可能的解決方案,”另一位對應的徐健教授說。該研究的作者。  

基於這項技術,研究人員開發了一種名為CAST-R的儀器,以支持在一個細胞水平上快速選擇抗生素和對病原體進行基因組測序。該儀器意味著更快,更精確的抗生素治療,以及更高的跟踪和抵抗細菌抗生素耐藥性的敏感性,這是對人類社會未來的重大威脅。

參考
通過拉曼活化重力驅動的封裝和測序對單個細菌細胞進行現象基因組分析。滕騰,龔艷海,蘇小璐,朱鵬飛,戴敬,徐健,馬波。納米,微型,小型,2020年6月9日,https://doi.org/10.1002/smll.202001172。

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